Museum Gunungapi Merapi dibangun dengan konsep desain budaya lokal. Konsep arsitektur bangunan Museum berasal dari bentuk gunung api, secara visual berbentuk kerucut yang memusat di bagian atasnya.
- Konsep budaya lokal diterapkan pada menara di atas bangunan yang merupakan representasi bentuk Tugu Yogyakarta.
- Tangga di depan pintu utama terinspirasi oleh Gerbang Candi Ratu Boko.
- Arah bangunan yang menghadap utara-selatan merupakan representasi filosofi budaya Jawa.
- Sementara teras luas di depan pintu masuk museum mengacu pada pelataran Candi Sambisari.
Implementasi desain menerapkan konsep arsitektur dan konsep budaya lokal dalam bangunan Museum Gunungapi Merapi. Hal tersebut terlihat pada bentuk bangunan museum yang mengerucut, mengecil di bagian atas dan besar di bagian bawah.
